Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GALPQ9UBC7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GALPQ9UBC7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms