Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HCN3Q9P1Z3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms