Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms