Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms