Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP5Q9NZZ3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP5Q9NZZ3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms