Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FBXL12Q9NXK8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms