Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNTLNQ9NXG0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTLNQ9NXG0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms