Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCIQ9NVI1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCIQ9NVI1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCIQ9NVI1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCIQ9NVI1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCIQ9NVI1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCIQ9NVI1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCIQ9NVI1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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