Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms