Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TM7SF3Q9NS93 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms