Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf4Q9NR00 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms