Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLMQ9NP87 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLMQ9NP87 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms