Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KIAA1549Q9HCM3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms