Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms