Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LY9Q9HBG7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LY9Q9HBG7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms