Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP4Q9H6H4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms