Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms