Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1BQ9H0U4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB1BQ9H0U4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms