Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms