Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRNKL1Q9BZJ0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRNKL1Q9BZJ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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