Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUS3Q9BZE2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUS3Q9BZE2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms