Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BCO2Q9BYV7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms