Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPCDR1Q9BY65 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPCDR1Q9BY65 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPCDR1Q9BY65 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPCDR1Q9BY65 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms