Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP3Q9BWW4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3Q9BWW4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms