Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC94Q9BW85 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms