Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIOK2Q9BVS4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RIOK2Q9BVS4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms