Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NUP58Q9BVL2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms