Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms