Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms