Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PKP4Q99569 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PKP4Q99569 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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PKP4Q99569 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PKP4Q99569 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PKP4Q99569 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PKP4Q99569 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PKP4Q99569 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PKP4Q99569 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PKP4Q99569 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP4Q99569 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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