Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP19Q99542 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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