Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms