Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNAQ96QF7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms