Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMD11Q96NU1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms