Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNBD2Q96M20 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms