Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms