Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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C2orf48Q96LS8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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C2orf48Q96LS8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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C2orf48Q96LS8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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C2orf48Q96LS8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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C2orf48Q96LS8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
C2orf48Q96LS8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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