Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2E2Q96LR5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2E2Q96LR5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms