Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms