Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C18orf8Q96DM3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms