Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3DQ96BQ1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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