Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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