Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms