Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NKD1Q969G9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NKD1Q969G9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms