Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STAG1Q8WVM7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms