Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX2-3Q8TAU0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-3Q8TAU0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms