Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHZ7

MBD3L2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L2Q8NHZ7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBD3L2Q8NHZ7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD3L2Q8NHZ7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms