Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms