Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BEST4Q8NFU0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms