Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms